揭示调控鱼类卵质决定和早期胚胎发育的关键因子，并阐明其作用的分子机制；创制高效特异的鱼类生殖细胞操作技术和基因编辑配子的“借腹生殖”技术；主持建成国际学术界公认的全球三大斑马鱼资源库之一——国家斑马鱼资源中心（http://zfish.cn）。在Genome Research、Nature Communications、PLOS Biology、PLOS Genetics、Cell Research、Science Bulletin等国内外学术期刊发表论文90多篇。